Želodčne težave (GERB) Običajen fiziološki pojav je, da želodec izloča želodčno kislino, ki sodeluje pri prebavi hrane. Zaradi različnih vzrokov se lahko količina izločene kisline čezmerno zveča ali se vrača v požiralnik, kar začne povzročati bolezenske težave. Okužba prebavil s H. pylori Večina ljudi, okuženih s H. pylori, nima bolezenskih težav, pri približno petini okuženih pa bakterija povzroči zdravstvene težave (razjede želodca in/ali dvanajstnika, vnetje želodčne sluznice, rak želodca ...). Črevesne težave Ko se ravnovesje črevesne mikrobiote poruši, se lahko pojavijo neprijetnosti, kot so zaprtje, driska, napenjanje in oslabljen obrambni sistem organizma. Zaprtje in hemoroidi Najpogostejša prebavna težava ljudi v razvitem svetu je zaprtje. Močno napenjanje pri odvajanju trdega, suhega blata zveča tlak v trebuhu in povzroči čezmerno polnjenje ven v zadnjiku, kar vodi v nastanek hemoroidov.
